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生物時鐘研究先趨亞秀夫主張依循自然規律可維持健康

本文刊載於 88/3/15 中國時報

鄧資新

慕尼黑大學生物醫學博士

中央研究院植物研究所博士後研究生

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【2008/10/30 17:37】 | [一上]書報討論 | TRACKBACK(0) | COMMENT(3)

SUSE 10 Enterprise Edition x86_64+Oracle 10.2 x86_64+MySql+Apache2安装

做個記錄，總有一天會用到。本來想先放上來，但是簡體字形印出來怪怪的，還是放連結好了。
http://www.kkwiki.com/forum/showthread.php?t=116

【2008/09/16 19:31】 | [其他]未分類 | TRACKBACK(0) | COMMENT(0)

Vista Business 64bit SP1 Diary

Vista business 64bit升級SP1後，提供了更多相容性軟體，也提供了相容於32bit軟體的整合。會另外新建一個Program files(x86)資料夾，存放32bit或XP版本的軟體。除了有些大型軟體需要特別下載64bit版本外，幾乎都能相容了。

以下測試成功軟體：
64bit
1.

32bit
1.Adobe Acrobat 9 Extend
2.foobar2000 0.9.5.5
3.

【2008/08/21 15:46】 | [其他]隨手筆記 | TRACKBACK(0) | COMMENT(0)

VNC for Opensuse

opensuse 已經有內建VNC Server了，只要去YaST→Remote Administration(VNC)設定Allow VNC
然後去下載VNC Server Free Edtion，使用裡面的VNC viewer連線.
注意：opensuse預設的port是5901，VNC的是5900，所以連線時的IP要打 "IP:port"
詳細圖請看：
1.VNC設定:http://lifestory.moqin.com/?p=441
　當VNC設定完後可以Check VNC是否連線。

#chkconfig Vlist|grep vnc
vnc: on
#netstat -tdlupn|grep 5901
tcp 0 0 0.0.0.0:5901 0.0.0.0:* LISTEN 3281/xinetd

PS: The 5901 port need to be assigned to your port forwarding rule if you have any router or firewall.

2.VNC連線:鳥哥

【2008/08/19 21:59】 | [程式]Linux | TRACKBACK(0) | COMMENT(0)

人體系統生物學 (Whole-body systems biology)

摘自：http://www.sciencenet.cn/blog/user_content.aspx?id=14372

人體系統生物學(Whole-body systems biology or global systems biology）有可能為中醫藥研究帶來新的生機，並最終促成中醫和西醫兩種貌似相反的醫學模式的匯聚與融合。

人體系統生物學是在Lee Hood領導的美國系統生物學研究所、Jeremy Nicholson領導的英國帝國理工的生物分子醫學系、Ian van der Greef領導的荷蘭TNO 醫學系統生物學實驗室以及陳竺領導的上海系統生物醫學研究中心等機構的探索和推動下正在蓬勃興起的一個新的學科方向。其主要觀點和技術特點如下：

1，細胞在生命活動的過程中會主動向胞外分泌代謝物和蛋白質。分泌到胞外的代謝物和蛋白質的組成譜(profiles)是細胞在特定的環境條件下，基因表達、蛋白質互作和代謝網絡運行的忠實而精細的分子水平的反映，可以看作是細胞生命活動留下的痕跡(footprints)。

2，多細胞的生物例如人體內的細胞分泌到胞外的代謝物和蛋白質主要在血液裡匯聚、循環並通過尿液排到體外。因此，血液和尿液等生物體液中的代謝物和蛋白質的組成譜可以精細而忠誠的反映人體各個器官、組織和細胞的生理以及病理狀態。

3，人體內共生著大量的微生物，多達1000多種，其細胞數量是人體自身細胞的10倍，其編碼的基因是人體自身基因數目的50－100倍。這些微生物的基因總和相當於人體的第二個基因組，叫「微生物組（Microbiome）」或者叫」人體元基因組（human metagenome)「。人的基因組與人體內的微生物組共同作用影響人體的免疫、營養和代謝過程。人的健康狀況發生變化，體內的共生微生物的組成就會發生變化；體內共生微生物的組成的變化也會導致人體的健康狀況的改變。因此，人體共生微生物，特別是腸道菌群的組成也可以忠實而精細的反映人體健康狀況。

3，因此，血液、尿液和糞便是反映人體健康狀況的最好的3個窗口。用代謝組學、基因組學和蛋白質組學等技術對大量人群的血、尿、便樣品進行精細而全面的定量測量，通過設置合理的對照人群，用多變量統計和模式識別對獲得的大量數據進行分析和建模，可以實現對完整人體的分子水平的精細測量，從而實現對人體健康狀況的盡可能精細和全面的測量。

4，人體系統生物學用分子方法研究只有完整人體才能具有的特性－人體系統水平的特性，與中醫通過測定脈搏和舌苔等系統水平特性判斷人體健康狀況、推斷體內病理過程、選擇干預措施和評價干預效果都具有整體觀的方法論特徵，但是，由於使用的是分子測定和數學統計相結合的策略，克服了中醫的模糊性、不確定性和經驗性的不足，又可以借鑒和發展中醫整體論的優勢，挖掘中醫藥中的寶貴積累。因此，是一個有可能促成中醫與西醫融合和匯聚並最終催生一種全新的醫學模式的新興的學科方向。

人體系統生物學的研究策略具有以下幾個特點：

a) 非破壞性Non-invasive or least invasive，測量的樣品（血、尿、便）容易採集，對人體沒有或只有很小的影響；

b) 整體性Global，測量的結果能夠反映人體全身的健康狀況，而不是僅僅反映某個器官或組織的健康狀況；

c) 動態性Dynamic，由於成本低、通量高，可以連續採集樣品進行測量，從而實現對人體健康狀況的動態監測；

d) 非靶向性Non-targeted，測量的窗口足夠寬，任何超過檢測靈敏度的異常的變化都能觀察到；

e) 分子的Molecular-based，測量的對象是代謝物、蛋白質和微生物的基因，全部是現代生物醫學已經有深入認識和比較成熟的分析技術的生物分子，有關這些生物分子組成和結構的數據可以與所有已知的生物醫學知識聯繫在一起進行分析，沒有學科障礙；

f) 數字化的Digital，測量結果是數字化的，便於定量和統計分析、模式識別等處理，所有人的數據可以在一個平台上進行分析和比較；

g) 生物學終點Biological endpoints，測定的對象是基因與環境互作以後的產物，而不僅僅只是基因本身，因此，能夠更加精細而準確的(more relevant)進行人體健康狀況的測定和預測。

這些特徵使得人體系統生物學與中醫藥具有天然的親和力，同時她又是植根於現代分子生物學之中的。

我們可以與名老中醫合作，不干預他們的診療過程，只是連續採集他們的病人在治療前、治療中和治療後的血、尿、便樣品，在積累了足夠的病例後，通過代謝組學（Metabonomics）、分泌組學(Secretomics)和元基因組學(Metagenomics)測定以及統計分析，觀察在中醫診斷和治療的過程中人體系統水平特性的變化及其與健康人群的對照關係，從而實現對中醫藥作用的全新的科學認識，做到去偽存真、去粗取精的目的。最終使中醫優秀的內核得到科學的承認和繼承、發揚、光大。
因此，人體系統生物學可以在中醫與西醫之間架起一座溝通的橋樑，從而不僅實現對中醫的科學詮釋，而且可以推動西醫向整體觀發展，克服其局部深入但整體破碎的缺點，最終有可能實現中醫與西醫的匯聚與融合，為形成一種全新的醫學模式做出貢獻。

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【2008/08/18 21:45】 | [其他]消息 | TRACKBACK(0) | COMMENT(0)

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